为揭示井窖深栽促进作物生长的理论机制,以常规移栽(膜上移栽)为对照,比较分析了井窖深栽烟苗的生理生化和转录组特征。结果表明:井窖深栽烟苗生长环境的平均气温为22.29℃,比常规移栽提高了4.76℃;环境相对湿度为97.10%,较常规移栽增加了58.97%;平均太阳光合有效辐射为221.selleck Ipatasertib57μmol/(m~2·s),比常规移栽降低了20.53%。与常规移栽相比,井窖深栽烟苗株高显著增加,最大叶面积显著增大,叶片水势显著提高29.92%~64.46%,叶片中超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)、过氧化物酶(peroxidase,POD)活性及丙二醛(malonaldehyde,MDA)含量分别降低了14.48%、8.86%和9.83%。转录组测序共发现4 845个差异CP-690550化学结构表达基因(differentially expressed genes,DEGs),其中下调表达基因2 693个;基因本体(gene ontology,GO)富集分析表明,下调DEGs主要富集于氧化还原过程和氧化还原酶活性等功能途径;京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析表明,DEGs最显著富集于黄酮类化合物生物合成途径,该途径关键酶查耳酮异构酶(chalcone isomerase,CHI)、柚皮素3-双加酶(naringenin 3-dioxygenase,F3H)、黄酮醇合成酶(flavonol synthase,FLS)、黄酮类单加氧酶(flavonoid 3′-hydroxylase,F3′H)、A3RT(anthocyanidin 3-O-glucoside-6”-O-rhamnosyltransferase)等的相关基因下调表达,常规移栽烟苗的二氢槲皮素、芦丁、山柰酚-3-O-葡萄糖苷、槲皮素-3-O-半乳糖苷、木犀草素、异鼠李素-3-O-芸香糖苷和山柰酚-3-O-芸香糖苷Patent and proprietary medicine vendors等7种黄酮类化合物含量显著高于井窖深栽烟苗。井窖深栽提高了移栽烟苗环境温湿度,降低了光合有效辐射通量,避免烟苗遭遇明显逆境胁迫,促进了烟苗生长发育。