动脉粥样硬化坏死性凋亡关键基因的筛选与验证

[目的]通过生物信息学方法筛选出动脉粥样硬化坏死性凋亡关键基因,并借助体外实验加以验证,从坏死性凋亡的角度来为预防和治疗动脉粥样硬化提供新策略。[方法]从GEO数据库下载与动脉粥样硬化斑块相关的基因,从GeneCards数据库下载与坏死性凋亡相关的基因,并将两者取交集从而获得动脉粥样硬化坏死性凋亡基因,进一步对基因的作用机制和信号通路进行基因本体论(G此网站O)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并构建蛋白质互作网络(PPI)和筛选关键基因,最后用终浓度为100 mg/L的氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)处理巨噬细胞,通过逆转录聚合酶链式反应和Westernblot法检测关键基因的表达情况。[结果]共获得动脉粥样硬化坏死性凋亡基因81个,通过GO和KEGG富selleck Liraglutide集分析发现其主要在内多肽酶活性的正向调节,IκB激酶/核因子κB 信号传导和自噬信号通路等方面显著富集;利用Cytoscape软件cytoHubba插件的5种计算方法得到热休克蛋白家族A(HSPA8)、信号传导及转录激活蛋白(STAT3)、血红素加氧酶1(HMOX1)、螯合体1(SQSTM1)和脂肪酸合成酶(FAS)5个关键基因。结果显示,与正常对照组相比,THP-1巨噬细胞中 ox-LDL处理组的HMOX1基因呈高表达(P<0.05),而HSPA8、STAT3、SQSTM1和FAS基因表达则无明显变化(P>0.05);RAW264.7巨噬细胞中 ox-LDL处理组的HMOX1、SQSTM1基因呈高表达(P<0.05),而HSPA8、STAT3和FAS基因表达无明early medical intervention显变化(P>0.05)。THP-1巨噬细胞中 HMOX1蛋白表达也相应升高。[结论] 研究显示 HMOX1 可能是动脉粥样硬化坏死性凋亡的关键基因,并有望成为动脉粥样硬化防治的新靶点。