基于生物信息学的系统性硬化症相关间质性肺病生物标志物分析

目的 利用生物信息学分析系统性硬化症相关间质性肺病(systemic sclerosis associated interstitial lung disease, SSc-ILD)的通路、生物标志物及诊断基因。方法 2023年4月-6月从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus)下载SSc-ILD相关的基因数据集进行差异分析,并进行基因本体、京lipid biochemistry都基因和基因组数据库、疾病本体及基因集富集分析等富集分析。运用最小绝对收缩和选择算子算法和支持向量机算法筛选取交集得到诊断基因,验证结果。对疾病相关数据进行免疫细胞浸润分析。结果 获Nirmatrelvir生产商得差异基因178个,富集分析显示与5种信号通路有关,与3种疾病有关。筛选出诊断基因为TNFAIP3、ID3、NT5DC2,免疫细胞浸润分析显示诊断基因与浆细胞、静息肥大细胞、活化自然杀伤细胞、巨噬细胞M1和M2、静息树突状细胞、活化树突获悉更多状细胞相关。结论 筛选出的诊断基因及免疫细胞可能参与SSc-ILD的发生。