清远麻鸡(Qingyuan partridge chicken)是CP-690550 IC50我国著名的优质地方鸡(Gallus gallus gallus)品种之一,已经历了20年系统地保种和利用,但其核心原种保种群体始终缺乏遗传多样性评价。本研究通过对国家级清远麻鸡原种保种场的选育群和保种群进行高通量测序,获得了清远麻鸡核心原种保种群体的99个线粒体基因组。在此基础上,本研究对清远麻鸡的线粒体基因组遗传多样性水平进行了全面评估,发现其线粒体基因组遗传多样性较高,编码基因COⅠ、ND4、COⅢ、ND2和Cytb及所有非编码基因的平均核苷酸差异数(K)均处于较高水平,说明清远麻鸡保种效果良好。比较分析保种群和选育群的遗传分化,结果表明保种群线粒体基因组遗传多样性高于选育群的,除了ND1和COⅡ单倍型多样度(H_d)低于选育群的外,保种群其余基因的单倍型多样度(H_d)均高于选育群的。通过两群体线粒体基因组selleck Alisertib编码区序列比对,发现选育群中共有30个错义突变位点,包括分别发生在ND3和ND5基因的2个激进变异;保种群有24个错义突变位点,包括COⅢ的1个中度激进突变和ND3的1个激进突变,提示清远麻鸡具有较大的选育潜力。本研究的结果对于清远麻鸡遗传资源的保护和评价,以及合理的开发和利用提供Biomass fuel了理论参考。