目的 探究活化转录因子4(activating transcription factor 4,ATF4)参与甲基化修饰与脂多糖(lipopolysaccharide, LPS)诱导巨噬细胞炎症反应的潜在关联。方法 对比分析应用LPS(LPS组)和PBS(对照组)处理小鼠单核巨噬细胞白血病细胞系(即RAW264.7细胞系)8 h后染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)和RNA高通量测序(RNA-seq)转录组分析表达谱的变化。采用京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)、基因本体(Gene Ontology, GO)分析，寻找与甲基化修饰相关通路，以及ATF4调控的甲基化修饰核心基因。应用MethPrimer平台在线预测ATF4参与巨噬细胞炎症反应甲基化修饰的关键靶基因的胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤(CpG)岛的分布情况。应用蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络分析，获取ATF4与这些关键蛋白质之间的调控关系。结果 LPS组ATF4蛋白质和mRNA的相对表达量均分别显著高于对照组(t=7.5philosophy of medicine07、4.771,P值均<0.001)。对LPS组开展ATF4的ChIP-seq和RNA-seq分析实验，并经KEGG和GO通路富集分析发现，ATF4参与巨噬细胞炎症反应的甲基化修饰相关基因为40个，其功能分别聚焦于组蛋白甲基化、组蛋白去甲基化、蛋白质甲基化、mRNA甲基化通路。进一步结合文献检索结果，根据上述40个基因是否存在CRE位点调控，筛选并获得ATF4调控甲基化修饰相关的7个潜在靶基因，即Brca1、Btg1、Carm1、Ezh2、Kdm3a、Kdm4b和Prmt6。应用MethPrimer平台在线预测7个基因翻译起始位点的CpG岛，发现Prmt6、Ezh2、Carm1分别有1个CpG岛，Kdm3a、Brca1、Kdm4b分别有2个C获悉更多pG岛，Btg1有3个CpG岛；提示ATF4潜在靶基因受甲基化修饰影响。PPI网络分析结果显示，Brca1、Btg1、Carm1、Ezh2、Kdm3a、Kdm4b、Prmt6之间分别存在交互作用。进一步通过Sangerbox 3.0在线分析网站的GO分析发现，Brca1、Btg1、Carm1、Ezh2、Kdm3a、Kdm4b、Prmt6的功能主要聚焦于组蛋白甲基化、组蛋白修饰、染色质的共价修饰等。结论 ATF4可能是巨噬细胞炎FUT-175分子量症反应过程中参与甲基化修饰的新型调节因子。