肺鳞癌中视黄酸诱导基因样受体家族的分子特征研究

通过转录组分析刻画肺鳞癌中视黄酸诱导基因样受体(Retinoic acid-inducible gene-like receptor, RLRs)家族的表达模式,结合PPI网络(Protein-Protein interaction network, PPI)和共表达分析筛选RLRs家族关键互作基因,探selleck Pevonedistat究RLRs家族基因表达与免疫分子和免疫细胞浸润的相关性,基于非小细胞肺癌免疫治疗数据探讨RLRs对于免疫耐受的影响,助力肺鳞癌免疫调控机制的研究。对下载的肺鳞癌mRNA表达数据,通过秩和检验方法探索RLRs家族成员在肺鳞癌中的表达差异,刻画其在不同癌症阶段的表达模式。进一步计算RLRs家族成员与互作基因的皮尔森相关性,识别显著互作基因进行富集分析。结合免疫调控和免疫细胞浸润数据,分析肺鳞癌中RLRs家族成员与三种免疫调节剂以及免疫细胞浸润的相关性。最后利用TIDE方法评估RLRs基因家族对于肺鳞癌患者免疫治疗受益性的影响,并通过COX回归验证RLRs家族成员的基因表达和肺鳞癌免疫治疗预后的关系。秩和检验发现RLRs家族成员在肺鳞癌的癌症患者中表达下调,且DHX58在肺鳞癌不同阶段随着分期表达下降。功能富集结果表明RLRs基因家族成员主要参与抗病毒的防御反应等生物学过程。免疫调控分析显示RLRs家族成员与MHC确认细节分子,免疫抑制剂,免疫刺激剂显著正相关,并且与B细胞、CD8+T细胞、CD4+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞的浸润均呈现正相关。RLRs基因能够影响肺鳞癌患者对于免疫治疗的https://bio.libretexts.org/Courses/Clinton_College/Microbiology_(Neely)/01受益程度,并且DDX58的高表达水平与免疫治疗患者较好预后相关。本研究揭示了RLRs家族成员在肺鳞癌中的表达失调,RLRs家族与肿瘤免疫微环境以及免疫治疗相关,DDX58有成为肺鳞癌预后分子标志物的潜力。