特发性膜性肾病尿外泌体lncRNA的表达谱分析及功能预测

目的:分析特发性膜性肾病(idiopathic membranous nephropathy,IMN)患者尿液外泌Medical coding体中差异表达的长链非编码RNA(long noncodingRNA,lncRNA)的表达谱,并进行功能预测,探讨其在IMN中可能的作用机制。方法:在NCBI-SRA数据库中下载5例ICompound 3MN样本和5例健康人对照(healthy control,HC)样本尿外泌体lncRNA的测序数据,应用生物信息学分析对差异表达的lncRNA进行聚类分析。通过基因本体论(Gene Ontology,GO)分析和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析预测IMN中差异表达的lncRNA的功能和可能参与的信号通路。结果:在IMN组和HC组之间共检测到14865个上调的lncRNA,22819个下调的lncRNA。将变化倍数(Fold change)≥2和P值≤0.05作为筛选标准,有353个lncRNA差异表达,分别为18个上调的lncRNA和335个下调的lncRNA。多数差异表达的lncRNA长度小于500nt,分布于常染色体,多来源于基因Gefitinib-based PROTAC 3间区。GO分析提示表达上调的lncRNA可能参与间充质干细胞凋亡过程、一氧化氮合成酶活性调节、激素代谢调控、热休克蛋白90结合等过程;表达下调的lncRNA可能参与白介素-10分泌等过程。KEGG分析提示上调的lncRNA可能参与m TOR信号通路、HIF-1信号通路;表达下调的lncRNA可能参与Rap1信号通路。结论:1.本研究揭示了IMN患者尿外泌体中差异表达的lncRNA的表达谱和功能特征。2.尿外泌体中差异表达的lncRNA可能通过mTOR信号通路、HIF-1信号通路、Rap1信号通路等途径参与IMN的发生发展。